تحليل معلوماتي حيوي يربط بين كريسبر والحمض النووي الفيروسي

لاحظ كل من فرانسيسكو موخيكا وألكسندر بولوتين وكريستين بوركيل، كلٌ بشكل مستقل عبر مقارنات معلوماتية حيوية، أن التتابعات الفريدة الفاصلة بين تكرارات كريسبر تطابق أجزاء من DNA فيروسات تصيب البكتيريا وبلازميدات. كانت هذه المطابقة القفزة المفاهيمية الحاسمة: فإذا كانت البكتيريا تحتفظ بمقاطع من الفيروسات التي هاجمتها، فقد يكون كريسبر شكلاً من أشكال الذاكرة المناعية المكتسبة. أعادت الفرضية تأطير ظاهرة بنيوية غامضة باعتبارها نظام دفاع، وإن استغرق إثباتها تجريبياً حتى عام 2007.